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[21]可以说，中世纪的大学管理处处体现着民主和自治，然而随着政府控制了大学的特许权，作为行会组织的大学亦逐渐失去其自治权[22]。
许多著名的高等教育思想家在论及大学的本质、使命、目的时也都论及自治这一基本的大学理念。
比如19世纪初对后世大学发展产生深远影响的洪堡（Humboldt），他对大学自治论述着眼于“科学”
：在“为了科学的大学”
中，教授享有Lehrfreiteit（教的自由），学生享有Ler（学的自由），这两种自由都必须依赖于大学这一组织，是相对于国家或地方的公共权力、经济权力、宗教、政治团体、家长甚至学生本身所具有的自治权[23]。
他认为唯一对大学有所限制的就是“真理”
，而这也正是“自治”
的最高标准，因为这样的大学既不为学生个人的职业前途，也不受社会政治经济力量的制约，其存在就是为了探求真理本身，在这个过程中也就实现了自治。
在近现代，对高等教育传统价值观满怀热忱的也不乏其人。
比如爱德华·希尔斯，他坚持认为大学应当成为基础科学和研究的家园，社会应该赋予个人在思想上和行动上免受不当限制的自由，学术机构同样应当为教授提供学术自由和让他们管理大学的自主权。
法国著名思想家雅克·德里达（JacquesDerrida）在《无条件的大学》一书中深入分析了全球化的发展趋势对大学的影响，倡言其心中理想的大学模式，“现代大学应当是无条件的［……］这个大学要求而且应当在原则上享有，除了人们所说的学术自由之外，提问题和建议的无条件的自由，甚至与公开言说对于真理的探求、认知和思想所要求的一切权利［……］大学以真理为业，它宣布并保证毫无保留地为真理而奋斗。”
[24]加拿大西蒙弗雷泽大学校长斯蒂文森（MichaelStevenson）认为：“大学自治影响西方和整个世界历史，我肯定相信只要大学能保卫其自主权，不再沦为政治势力和控制的受害者，那么大学还能对人类历史有重大贡献。”
[25]
与德里达“无条件的大学”
不同，许多学者在维护大学自治理念的同时，也提出自治应当具有限度。
美国当代思想家德里克·博克（DerekBok）认为大学自治就是“智力完整性不受政府条例或其他外部责难的侵扰”
[26]，但他同时也指出，为了维护公众的利益，政府有时可以对大学做出适当的约束。
2001年，雅克·朗（Jag）在任法国国家教育部长时出席了在里尔举行的法国大学校长联席会议——事实上，根据1971年法令，成立大学校长联席会议的初衷也是要保障法国大学的自治，在其成立之初，大学校长联席会议就因为其成员的地位而享有声誉，随后它迅速地开始讨论并影响法国教育部的政策决策——朗在此次会议开幕式的发言中也提出实现大学自治的几个条件：首先，是要发展合同政策[27]，其次，是要推广校长负责制，最后，是要加强对大学的评估工作[28]。
林肯大学校长罗杰·金（R）特别强调了法人身份对于大学自治的重要性：“大学以前把自己看成是个人的组合（为了实现自治，这种看法会周期性地出现），但现在大学认为：法人组织是大学合法的‘外表’。
这种观念的转变一般是很慢的。
近年来，由于各种需要（包括加强对经费的控制、明确经济责任以及对人的管理职能的加强等），这些发展加快了。”
[29]也就是说，仅仅构成大学的学者实现学术自由是不够的，大学还需要实现其内政自治权，即包括规章制度制定权、教学研究自主权以及组织自主权。
范德格拉夫（JohnH.VandeGraaff）主编的《学术权力——七国高等教育管理体制比较》从权力的角度解构了大学自治的可能与必要性。
他指出，“外部的权力（包括政府、市场）和内部学术权力之间的博弈决定着大学自治的程度，也决定着政府和社会能在多大程度上监督大学，使大学对社会负责；能在多大程度上规划大学的发展，使大学不断创新”
[30]，其实也就是外部智力的关系，即国家与大学之间的关系影响着大学功能的实现。
正如1998年欧洲比较教育协会副主席尼夫（GuyNeave）在联合国教科文组织召开的国际高等教育大会上所做的一份题为“自治、社会责任与学术自由”
的报告中所指出的：为了能够让大学承担起社会赋予它的责任，两个条件是必须的：一是大学自治；二是学术自由。
不论是从理论还是现实意义上来讲，自治对于大学不仅仅是秉承传统留下的特质，更是大学能够完整地履行其使命的基本条件[31]。
尼夫个人在对大学自治进行研究时，分析了四种模式，分别为巴黎模式、博洛尼亚模式、洪堡模式和英国模式[32]。
巴黎模式是典型的教师行会，教授制定大学的学术标准、筛选学生、对学生进行考察，并掌握“授课许可”
的颁发。
博洛尼亚模式则是学生的自治模式。
洪堡模式来自19世纪柏林大学改革，它“结合了学的自由与教的自由，并建立其特殊的教学自治形式——教席制度”
，教席教授[33]代表大学自我管理的基层组织——学院，掌握着教学人员招聘、课程制定、确定学科发展方向、教授资格考试等重要事务权。
这种“教授大学”
的模式在当时影响巨大。
英国大学在法律上是私立的，或者靠信托财产而生或者靠皇室授予的大学特许状而生，英国的自治模式最符合自由主义理念。
生物学家出身的艾瑞克·阿什比（EricAshby）从生物学的角度来看待大学及其发展，他认为：“大学是继承西方文化的机构。
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